Eisa

doi:10.18129/b9.bioc.eisa

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅Eisa

通过迭代签名算法的表达数据分析

生物导体版本:3.11

迭代签名算法(ISA)是一种双簇方法。它发现基因表达(或其他表格)数据中的相关块(转录模块)。ISA能够找到重叠的模块,并且对噪声具有弹性。该软件包使用标准的生物导体数据结构为ISA提供了方便的接口;还包含各种可视化工具,可与其他双簇算法一起使用。

作者:gmail.com> gabor csardi

维护者:gmail.com> Gabor csardi

引用(从r内,输入引用(“ eisa”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ eisa”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ eisa”)

PDF R脚本 用于基因表达数据的迭代签名算法
PDF 参考手册

细节

生物浏览 分类,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,软件,,,,可视化
版本 1.40.0
在生物导体中 Bioc 2.6(R-2.11)(10。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 ISA2,,,,生物酶(> = 2.17.8),AnnotationDbi, 方法
进口 生物基因,,,,类别,,,,GeneFilter,,,,DBI
链接
建议 Igraph(> = 0.6),矩阵,,,,gostats,,,,go.db,,,,kegg.db,,,,biclust,,,,大量的,,,,Xtable,,,,全部,,,,HGU95AV2.DB,,,,targetscan.hs.eg.db,,,,org.hs.eg.db
系统要求
增强
URL
取决于我 ExpressionView
进口我 ExpressionView
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 eisa_1.40.0.tar.gz
Windows二进制 eisa_1.40.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) eisa_1.40.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eisa
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/eisa
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/eisa/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户