此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅Eisa。
生物导体版本:3.11
迭代签名算法(ISA)是一种双簇方法。它发现基因表达(或其他表格)数据中的相关块(转录模块)。ISA能够找到重叠的模块,并且对噪声具有弹性。该软件包使用标准的生物导体数据结构为ISA提供了方便的接口;还包含各种可视化工具,可与其他双簇算法一起使用。
作者:gmail.com> gabor csardi
维护者:gmail.com> Gabor csardi
引用(从r内,输入引用(“ eisa”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ eisa”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ eisa”)
R脚本 | 用于基因表达数据的迭代签名算法 | |
参考手册 |
生物浏览 | 分类,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.40.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.6(R-2.11)(10。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | ISA2,,,,生物酶(> = 2.17.8),AnnotationDbi, 方法 |
进口 | 生物基因,,,,类别,,,,GeneFilter,,,,DBI |
链接 | |
建议 | Igraph(> = 0.6),矩阵,,,,gostats,,,,go.db,,,,kegg.db,,,,biclust,,,,大量的,,,,Xtable,,,,全部,,,,HGU95AV2.DB,,,,targetscan.hs.eg.db,,,,org.hs.eg.db |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | ExpressionView |
进口我 | ExpressionView |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | eisa_1.40.0.tar.gz |
Windows二进制 | eisa_1.40.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | eisa_1.40.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eisa |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/eisa |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/eisa/ |
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