gcrisprtools
doi：10.18129/b9.bioc.gcrisprtools
此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅gcrisprtools。
合并CRISPR屏幕QC和分析的功能套件
生物导体版本：3.11
一组用于评估汇总高通量筛查实验的工具，通常采用CRISPR/CAS9或SHRNA表达盒。包含在实验中询问库和盒式行为的方法，识别差异丰富的盒式录音带，汇总信号以识别候选目标的经验验证，假设测试和全面报告。
作者：罗素·贝纳尔（Russell Bainer），达里乌斯·拉特曼（Dariusz Ratman），史蒂夫·利亚诺格洛（Steve Lianoglou），彼得·哈弗蒂（Peter Haverty）
维护者：Russell Bainer
引用（从r内，输入引用（“ gcrisprtools”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ gcrisprtools”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ gcrisprtools”）
| html | R脚本 | example_workflow_gcrisprtools |
| html | R脚本 | gcrisprtools_vignette |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 生物医学信息学，，，，CRISPR，，，，细胞生物学，，，，差异性，，，，实验设计，，，，功能基因组学，，，，基因烯，，，，遗传学，，，，免疫学，，，，多重组合，，，，正常化，，，，药物遗传学，，，，药物基因组学，，，，合并屏幕，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，回归，，，，软件，，，，系统生物学，，，，可视化 |
| 版本 | 1.16.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.4（R-3.3）（4年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.6） |
| 进口 | 生物酶，，，，林玛，，，，Robustrankaggreg，，，，GGPLOT2，，，，panther.db，，，，rmarkDown，grdevices，图形，统计，utils，并行，总结性特征 |
| 链接 | |
| 建议 | EDGER，，，，尼特， 网格，AnnotationDbi，，，，org.mm.eg.db，，，，org.hs.eg.db，，，，运行，，，，生物基因 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | gcrisprtools_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | gcrisprtools_1.16.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | gcrisprtools_1.16.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gcrisprtools |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/gcrisprtools |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/gcrisprtools/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
