gscreend

DOI:10.18129 / B9.bioc.gscreend

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见gscreend．

汇总基因筛选分析

Bioconductor版本:3.11

用于汇总基因筛选分析的软件包(例如CRISPR-KO)。这种筛选的分析是基于细胞增殖阶段前后gRNA丰度的比较。gscreend包将gRNA计数作为输入，并允许检测基因敲除减少或增加细胞增殖。

作者:Katharina Imkeller [cre, aut]， Wolfgang Huber [aut]

维护者:Katharina Imkeller

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("gscreend")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“gscreend”)

超文本标记语言	R脚本	Example_simulated
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CRISPR，PooledScreens，软件，StatisticalMethod
版本	1.2.0
在Bioconductor	bio3.10 (R-3.6)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6)
进口	SummarizedExperiment，nloptr，fGarch、方法、BiocParallel、图形
链接
建议	knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/imkeller/gscreend
BugReports	https://github.com/imkeller/gscreend/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	gscreend_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	gscreend_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	gscreend_1.2.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gscreend
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gscreend
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/gscreend/
软件包下载报告	下载数据