gsean

DOI:10.18129 / B9.bioc.gsean

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见gsean．

网络基因集富集分析

Bioconductor版本:3.11

生物体中的生物分子很少单独起作用。他们通常以合作的方式相互作用。生物过程过于复杂，如果不考虑这种相互作用，就无法理解。因此，基于网络的程序可以被视为研究复杂过程的强大方法。然而，人们设计了许多方法来分析单个基因。据说，基于生物网络的技术，如基因共表达，比仅使用基因列表的技术更精确地表示信息。该软件包旨在整合基因表达和生物网络。利用基因表达数据构建生物网络，并将其用于基因集富集分析。

作者:Jung Dongmin

维护者:Dongmin Jung

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("gsean")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“gsean”)

超文本标记语言	R脚本	gsean
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，网络，NetworkEnrichment，通路，软件，StatisticalMethod
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5)，fgsea，PPInfer
进口
链接
建议	SummarizedExperiment，knitr，情节，排名，WGCNA
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	gsean_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	gsean_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	gsean_1.8.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gsean
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gsean
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/gsean/
软件包下载报告	下载数据