iChip

DOI:10.18129 / B9.bioc.iChip

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见iChip．

基于隐Ising模型的芯片数据贝叶斯建模

Bioconductor版本:3.11

隐藏的Ising模型被用于识别ChIP-chip数据中的丰富基因组区域。它们可以用于分析来自多个平台(如Affymetrix、Agilent和NimbleGen)的数据，以及具有单个到多个副本的数据。

作者:Qianxing帽

维护者:钱星莫<钱星。莫在moffitt.org >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("iChip")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“iChip”)

PDF	R脚本	iChip
PDF		参考手册

细节

biocViews	AgilentChip，ChIPchip，微阵列，OneChannel，软件
版本	1.42.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (R-2.11)(10.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.10.0)
进口	limma
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	iChip_1.42.0.tar.gz
Windows二进制	iChip_1.42.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	iChip_1.42.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iChip
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ iChip
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/iChip/
包下载报告	下载数据