此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅Isomirs。
生物导体版本:3.11
miRNA和异构体的表征,聚类和差异表达。
作者:Lorena Pantano [AUT,CRE],佐治亚州埃斯卡米斯[aut]
维护者:lorena pantano
引用(从r内,输入引用(“ Isomirs”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ isomirs”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Isomirs”)
html | R脚本 | miRNA和Isomir分析 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 聚类,,,,差异性,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,软件,,,,mirna |
版本 | 1.16.2 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(4。5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | r(> = 3.5),歧视者,,,,总结性特征 |
进口 | AnnotationDbi,,,,断言,,,,生物基因,,,,生物酶,,,,扫帚,,,,簇,,,,牛仔图,,,,DegReport,,,,deseq2,,,,iranges,,,,dplyr,,,,基因组机,,,,GPLOTS,,,,GGPLOT2,,,,gtools,,,,栅格,网格,grdevices,图形,ggally,,,,林玛, 方法,rcolorbrewer,,,,readr,,,,重塑,,,,rlang,统计Stringr,,,,S4VECTORS,,,,花花公子,,,,蒂布尔 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,org.mm.eg.db,,,,targetscan.hs.eg.db,,,,pheatmap,,,,生物使用,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/lpantano/isomirs/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | isomirs_1.16.2.tar.gz |
Windows二进制 | isomirs_1.16.2.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | isomirs_1.16.2.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isomirs |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/isomirs |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/isomirs/ |
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