莱斯

DOI:10.18129 / B9.bioc.les

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见莱斯．

识别贴片微阵列数据中的差异效应

Bioconductor版本:3.11

'les'包估计平铺微阵列数据中的增强显著性位点(les)。这些是调控区域，如在差异转录、芯片芯片或DNA修饰分析中发现的。该软件包提供了一个适用于识别贴片微阵列数据集中的差异效应的通用框架，并且独立于单个探针级别的底层统计信息。

作者:Julian Gehring, Clemens Kreutz, Jens Timmer

维护者:Julian Gehring

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes (les)

PDF	R脚本	les软件包简介:用增强显著性框架的位点识别贴片微阵列数据中的差异效应
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ChIPchip，DNAMethylation，DifferentialExpression，微阵列，软件，转录
版本	1.38.0
Bioconductor自	BioC 2.7 (R-2.12)(10年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 2.13.2)，方法，图形，fdrtool
进口	引导，gplots，RColorBrewer
链接
建议	Biobase，limma
SystemRequirements
增强了	平行
URL
取决于我
进口我	GSRI
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	les_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	les_1.38.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	les_1.38.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/les
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/莱斯
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/les/
包下载报告	下载数据