macat

DOI:10.18129 / B9.bioc.macat

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见macat．

微阵列染色体分析工具

Bioconductor版本:3.11

这个文库包含功能，以调查差异基因表达和基因的染色体定位之间的联系。MACAT的动机是对肿瘤细胞中涉及大染色体区域的常见现象的观察。MACAT是用于识别显著差异表达的染色体区域的统计方法的实施。这些函数已经在一个关于急性淋巴细胞白血病(Yeoh et al.Cancer Cell 2002)的公开数据集上进行了测试，该数据集在“stjudem”库中提供。

作者:Benjamin Georgi, Matthias Heinig, Stefan Roepcke, Sebastian Schmeier, Joern Toedling

维护者:Joern Toedling

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“macat”)

PDF	R脚本	微阵列染色体分析工具
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，微阵列，软件，可视化
版本	1.62.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase，注释
进口
链接
建议	hgu95av2.db，stjudem
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	macat_1.62.0.tar.gz
Windows二进制	macat_1.62.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	macat_1.62.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/macat
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/macat
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/macat/
软件包下载报告	下载数据