missRows

DOI:10.18129 / B9.bioc.missRows

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见missRows

多组学数据集成中缺失个体的处理

Bioconductor版本:3.11

missRows包实现了MI-MFA方法,以处理多组学数据集成中缺失的个体(“生物单位”)。MI-MFA方法从一个多因素分析模型中生成多个估计数据集,然后将结果合并到一个单一的共识解中。该包提供了估计个体和变量坐标、推断缺失个体和各种诊断图的功能,以检查缺失的模式和可视化由于缺失值而产生的不确定性。

作者:Ignacio Gonzalez和Valentin Voillet

维护者:冈萨雷斯·伊格纳西奥<伊格纳西奥。冈萨雷斯在bbox.fr>

引用(从R中,输入引用(“missRows”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("missRows")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“missRows”)

PDF R脚本 missRows
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DimensionReductionMathematicalBiologyPrincipalComponent软件StatisticalMethod可视化
版本 1.8.0
在Bioconductor公司 BioC 3.7 (R-3.5)(2.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 3.5),方法,ggplot2grDevices,MultiAssayExperiment
进口 plyr统计数据,gtoolsS4Vectors
链接
建议 BiocStyleknitrtestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
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给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 missRows_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 missRows_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) missRows_1.8.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/missRows
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/missRows
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/missRows/
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