该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见马赛克.
Bioconductor版本:3.11
该软件包提供了拼接MOSAiCS和MOSAiCS- hmm的功能,这是一个统计框架,用于分析转录因子结合和组蛋白修饰的单样本或双样本ChIP-seq数据。
作者:钟东军,宽裴芬,Rene Welch, Sunduz Keles
维护者:钟东军<东军。Chung在gmail.com>
引用(来自R,输入引用(“马赛克”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("mosaics")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“马赛克”)
R脚本 | 马赛克 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,ChIPseq,遗传学,测序,软件,转录 |
版本 | 2.26.0 |
在Bioconductor中 | BioC 2.8 (R-2.13)(9.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 3.0.0),方法,图形,Rcpp |
进口 | 质量样条函数,晶格,IRanges,GenomicRanges,GenomicAlignments,Rsamtools,GenomeInfoDb,S4Vectors |
链接 | Rcpp |
建议 | mosaicsExample |
SystemRequirements | Perl |
增强了 | 平行 |
URL | http://groups.google.com/group/mosaics_user_group |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | mosaics_2.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | mosaics_2.26.0.zip(32- & 64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | mosaics_2.26.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosaics |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mosaic |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/mosaics/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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