马赛克

DOI:10.18129 / B9.bioc.mosaics

该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见马赛克

基于模型的ChIP-Seq一、二样本分析与推断

Bioconductor版本:3.11

该软件包提供了拼接MOSAiCS和MOSAiCS- hmm的功能,这是一个统计框架,用于分析转录因子结合和组蛋白修饰的单样本或双样本ChIP-seq数据。

作者:钟东军,宽裴芬,Rene Welch, Sunduz Keles

维护者:钟东军<东军。Chung在gmail.com>

引用(来自R,输入引用(“马赛克”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("mosaics")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“马赛克”)

PDF R脚本 马赛克
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学ChIPseq遗传学测序软件转录
版本 2.26.0
在Bioconductor中 BioC 2.8 (R-2.13)(9.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 3.0.0),方法,图形,Rcpp
进口 质量样条函数,晶格IRangesGenomicRangesGenomicAlignmentsRsamtoolsGenomeInfoDbS4Vectors
链接 Rcpp
建议 mosaicsExample
SystemRequirements Perl
增强了 平行
URL http://groups.google.com/group/mosaics_user_group
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 mosaics_2.26.0.tar.gz
Windows二进制 mosaics_2.26.0.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra) mosaics_2.26.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosaics
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mosaic
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/mosaics/
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