菲尔

doi:10.18129/b9.bioc.philr

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅菲尔

基于系统发育分区的ILR转换宏基因组学数据

生物导体版本:3.11

Philr对于系统发育等距记录比率变换而言是缩写。该软件包提供了用于分析组成数据的功能(例如,代表不同变量/零件比例的数据)。具体而言,该软件包允许分析组合数据,其中零件可以通过系统发育树(在微生物群调查数据中很常见)相关,并使从系统发育树构建的等距对数比率转换可用,并利用加权参考度量。

作者:贾斯汀·西尔弗曼

维护者:贾斯汀·西尔弗曼(Justin Silverman)

引用(从r内,输入引用(“ Philr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ philr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Philr”)

html R脚本 菲尔简介
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文本 消息

细节

生物浏览 免疫学,,,,宏基因组学,,,,微生物组,,,,测序,,,,软件
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(4年)
执照 GPL-3
要看
进口 ,,,,Phangorn,,,,花花公子,,,,GGPLOT2,,,,格特里
链接
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,门索,,,,Glmnet,,,,dplyr
系统要求
增强
URL https://github.com/jsilve24/philr
BugReports https://github.com/jsilve24/philr/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 philr_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 philr_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Philr_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/philr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/philr
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/philr/
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