rtandem

doi:10.18129/b9.bioc.rtandem

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅rtandem

将串联蛋白识别算法接口R中

生物导体版本:3.11

该软件包将串联蛋白识别算法在R中连接。可以通过使用AS唯一参数来启动X!tandem样式的标识。但是rtandem aslo提供了扩展的语法和功能来简化启动分析,以及将结果,参数和分类学转换为/来自R的函数。

作者:Crchuq.ulaval.ca> Frederic Fournier ,Rene Paradis ,arnaud droit arnaud.droit在crchuq.ulaval.ca>

维护者:frederic fournier <弗雷德里克。

引用(从r内,输入引用(“ rtandem”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rtandem”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rtandem”)

PDF R脚本 rtandem用户指南
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 免疫学,,,,质谱,,,,蛋白质组学,,,,软件
版本 1.27.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(7。5年)
执照 Artistic-1.0 |文件执照
要看 XML,,,,RCPP,,,,Data.Table(> = 1.8.8)
进口 方法
链接 RCPP
建议 Biomart
系统要求 RTANDEM使用外籍和Pthread库。有关详细信息,请参见README文件。
增强
URL
取决于我 PGA,,,,Sapfinder,,,,Shinytandem
进口我 proteoqc
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rtandem_1.27.0.tar.gz
Windows二进制 rtandem_1.27.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rtandem
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rtandem
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/rtandem/
软件包下载报告 下载统计

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