此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅rtrm。
生物导体版本:3.11
RTRM从蛋白质 - 蛋白质相互作用网络中识别转录调节模块(TRM)。
作者:迭戈·迪兹
维护者:迭戈·迪兹(Diego Diez)
引用(从r内,输入引用(“ rtrm”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rtrm”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ rtrm”)
R脚本 | RTRM简介 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结肠管制,,,,GraphandNetwork,,,,网络,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 1.26.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(7年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 2.10),Igraph(> = 1.0) |
进口 | AnnotationDbi,,,,DBI,,,,rsqlite |
链接 | |
建议 | 运行,,,,生物基因,,,,主题,,,,图形,,,,pwmenrich,,,,Biomart,,,,尼特,,,,生物弦,,,,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm8.masked,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,GGPLOT2 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/ddiez/rtrm |
BugReports | https://github.com/ddiez/rtrm/issues |
取决于我 | |
进口我 | rtrmui |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rtrm_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | rtrm_1.26.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | rtrm_1.26.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rtrm |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rtrm |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rtrm/ |
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