rtrm

doi:10.18129/b9.bioc.rtrm

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅rtrm

识别来自PPI网络的转录调节模块

生物导体版本:3.11

RTRM从蛋白质 - 蛋白质相互作用网络中识别转录调节模块(TRM)。

作者:迭戈·迪兹

维护者:迭戈·迪兹(Diego Diez)

引用(从r内,输入引用(“ rtrm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rtrm”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rtrm”)

PDF R脚本 RTRM简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结肠管制,,,,GraphandNetwork,,,,网络,,,,软件,,,,转录
版本 1.26.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(7年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 2.10),Igraph(> = 1.0)
进口 AnnotationDbi,,,,DBI,,,,rsqlite
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,主题,,,,图形,,,,pwmenrich,,,,Biomart,,,,尼特,,,,生物弦,,,,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm8.masked,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,GGPLOT2
系统要求
增强
URL https://github.com/ddiez/rtrm
BugReports https://github.com/ddiez/rtrm/issues
取决于我
进口我 rtrmui
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rtrm_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 rtrm_1.26.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) rtrm_1.26.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rtrm
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rtrm
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/rtrm/
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