randRotation

DOI:10.18129 / B9.bioc.randRotation

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅randRotation。

随机旋转与批处理高维数据结构的方法

Bioconductor版本:3.11

的集合的方法来执行随机正交变换(随机旋转)高维数据(如微阵列或RNA-seq数据)与批处理结构。随机旋转方法允许精确的测试相关的测试统计线性模型任意后,尤其是非线性,批处理效应校正方法。包进一步提供了估算方法的局部自由度数据映射。

作者:彼得Hettegger (aut (cre)

维护人员:彼得Hettegger < p。在gmail.com hettegger >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“randRotation”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“randRotation”)

HTML	R脚本	随机旋转方案介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect,BiomedicalInformatics,DifferentialExpression,GeneExpression,遗传学,MicroRNAArray,微阵列,归一化,预处理,RNASeq,测序,软件,StatisticalMethod
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	方法、图形跑龙套,统计数据,Rdpack(> = 0.7)
链接
建议	knitr,BiocParallel,lme4,rmarkdown,BiocStyle,testthat(> =魅惑,limma,股东价值分析
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/phettegger/randRotation
BugReports	https://github.com/phettegger/randRotation/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	randRotation_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	randRotation_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	randRotation_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/randRotation
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ randRotation
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/randRotation/
包下载报告	下载数据