regsplice

doi:10.18129/b9.bioc.regsplice

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅regsplice

基于L1调查的方法检测微分剪接的方法

生物导体版本:3.11

使用L1指导(LASSO)来检测RNA-Seq和外显子微阵列数据中差异剪接(差异外显子使用)的统计方法。

作者:Lukas M. Weber [AUT,CRE]

维护人员:lukas M. Weber

引用(从r内,输入引用(“ Regsplice”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ regsplice”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Regsplice”)

html R脚本 Regsplice工作流程
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 替代方案,,,,差异性,,,,差速器,,,,exonarray,,,,实验设计,,,,免疫学,,,,微阵列,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(4年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看
进口 Glmnet,,,,总结性特征,,,,S4VECTORS,,,,林玛,,,,EDGER,统计pbapply,utils,方法
链接
建议 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/lmweber/regsplice
BugReports https://github.com/lmweber/regsplice/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 regsplice_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 regsplice_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) regsplice_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regsplice
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/regsplice
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/regsplice/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户