安全

DOI:10.18129 / B9.bioc.safe

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见安全．

功能与表达的显著性分析

Bioconductor版本:3.11

SAFE是一种在基因表达实验中检测功能类别的重采样方法。SAFE可以应用于两样本和多类比较，或简单的线性回归。其他实验设计也可以通过用户定义的函数来适应。

作者:威廉·t·巴里

维护者:Ludwig Geistlinger < Ludwig。Geistlinger在sph.cuny.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("safe")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“安全”)

PDF	R脚本	安全手册
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneSetEnrichment，通路，软件，StatisticalMethod
版本	3.28.1
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.4.0)，AnnotationDbi，Biobase、方法、SparseM
进口
链接
建议	GO.db，PFAM.db，reactome.db，hgu133a.db，breastCancerUPP，生存，foreach，doRNG，Rgraphviz，GOstats
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	EGSEA，EnrichmentBrowser
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	safe_3.28.1.tar.gz
Windows二进制	safe_3.28.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	safe_3.28.1.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/safe
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/safe
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/safe/
软件包下载报告	下载数据