sapFinder

DOI:10.18129 / B9.bioc.sapFinder

该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见sapFinder．

猎枪蛋白质组学中变异肽检测和可视化软件包。

Bioconductor版本:3.11

sapFinder的开发是为了自动化(1)变异相关数据库的构建，(2)数据库搜索，(3)后处理，(4)基于html的霰弹枪蛋白质组学报告生成。

作者:徐绍航，文博

维护人员:徐少航， Bo Wen

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("sapFinder")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“sapFinder”)

PDF	R脚本	sapFinder装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology，MassSpectrometry，蛋白质组学，RNASeq，ReportWriting，单核苷酸多态性，软件，可视化
版本	1.26.0
在Bioconductor中	BioC 2.14 (R-3.1)(6.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.0.0)，rTANDEM(> = 1.3.5)
进口	pheatmap，Rcpp(>= 0.10.6)，图形，grDevices，统计，utils
链接	Rcpp
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	sapFinder_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	sapFinder_1.26.0.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	sapFinder_1.26.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/sapFinder
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/sapFinder
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/sapFinder/
软件包下载报告	下载数据