此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅简单。
生物导体版本:3.11
提供高级函数来读取Affy .cel文件,表型数据,然后使用它计算简单的内容,例如t检验,折叠更改等。大量使用Affy Library。还具有一些基本的散点图和生成高分辨率期刊人物的机制...
作者:Crispin J Miller
维护者:Crispin Miller
引用(从r内,输入引用(“简单”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ simpleaffy”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ Simpleaffy”)
R脚本 | 简单的底漆 | |
参考手册 | ||
文本 | 读书我 |
生物浏览 | 注解,,,,DataImport,,,,差异性,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,报告写作,,,,软件,,,,转录,,,,可视化 |
版本 | 2.64.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 15.5岁) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 2.0.0),方法,UTILS,GRDEVICES,GRAPHICS,STATS,生物基因(> = 0.1.12),生物酶,,,,副词(> = 1.33.6),GeneFilter,,,,GCRMA |
进口 | 方法,UTILS,GRDEVICES,图形,统计信息,生物基因,,,,生物酶,,,,副词,,,,GeneFilter,,,,GCRMA |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.andersvercelli.comhttp://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/ |
取决于我 | Yaqcaffy |
进口我 | Affyqcreport,,,,arraymvout |
建议我 | AffyExpress,,,,Arraytools,,,,弯头 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | simpleaffy_2.64.0.tar.gz |
Windows二进制 | SimpleAffy_2.64.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | Simpleaffy_2.64.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/simpleaffy |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/simpleaffy |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/simpleaffy/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |