简单

doi:10.18129/b9.bioc.simpleaffy

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅简单

非常简单的Affymetrix数据的高水平分析

生物导体版本:3.11

提供高级函数来读取Affy .cel文件,表型数据,然后使用它计算简单的内容,例如t检验,折叠更改等。大量使用Affy Library。还具有一些基本的散点图和生成高分辨率期刊人物的机制...

作者:Crispin J Miller

维护者:Crispin Miller

引用(从r内,输入引用(“简单”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ simpleaffy”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ Simpleaffy”)

PDF R脚本 简单的底漆
PDF 参考手册
文本 读书我

细节

生物浏览 注解,,,,DataImport,,,,差异性,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,报告写作,,,,软件,,,,转录,,,,可视化
版本 2.64.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 15.5岁)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 2.0.0),方法,UTILS,GRDEVICES,GRAPHICS,STATS,生物基因(> = 0.1.12),生物酶,,,,副词(> = 1.33.6),GeneFilter,,,,GCRMA
进口 方法,UTILS,GRDEVICES,图形,统计信息,生物基因,,,,生物酶,,,,副词,,,,GeneFilter,,,,GCRMA
链接
建议
系统要求
增强
URL //www.andersvercelli.comhttp://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/
取决于我 Yaqcaffy
进口我 Affyqcreport,,,,arraymvout
建议我 AffyExpress,,,,Arraytools,,,,弯头
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 simpleaffy_2.64.0.tar.gz
Windows二进制 SimpleAffy_2.64.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) Simpleaffy_2.64.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/simpleaffy
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/simpleaffy
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/simpleaffy/
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