SitePath

doi:10.18129/b9.bioc.sitepath

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅SitePath

检测蛋白质进化中氨基酸取代的位点

生物导体版本:3.11

该软件包在给定多个序列比对和系统发育树的情况下对固定事件进行分层搜索。这些固定事件可以特定于系统发育谱系或由多个谱系共享。

作者:木王,aiping wu

维护者:校长

引用(从r内,输入引用(“ sitepath”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ sitepath”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ sitepath”)

html R脚本 站点路的基本工作流程
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 结盟,,,,乘以quessequealignment,,,,系统发育学,,,,SNP,,,,软件
版本 1.4.2
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(1。5年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.6.0)
进口 ,,,,seqinr,,,,RCPP,方法,图形,utils,统计
链接 RCPP
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/wuaipinglab/sitepath
BugReports https://github.com/wuaipinglab/sitepath/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 sitepath_1.4.2.tar.gz
Windows二进制 sitePath_1.4.2.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) sitepath_1.4.2.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sitepath
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/sitepath
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/sitepath/
软件包下载报告 下载统计

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  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户