snpstats

doi：10.18129/b9.bioc.snpstats

此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅snpstats。

SNPMATRIX和XSNPMATRIX类和方法

生物导体版本：3.11

大型SNP关联研究的类和统计方法。这扩展了早期的SNPMATRIX软件包，从而允许基因型的不确定性。

作者：David Clayton

维护者：David Clayton

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ snpstats”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ snpstats”）

PDF	R脚本	数据输入
PDF	R脚本	FST
PDF	R脚本	插补和荟萃分析
PDF	R脚本	LD统计
PDF	R脚本	主要组件分析
PDF		snpmatrix-differences
PDF	R脚本	SNPSTATS简介
PDF	R脚本	TDT测试
PDF		参考手册

细节

生物浏览	遗传因素，，，，微阵列，，，，SNP，，，，软件
版本	1.38.0
在生物导体中	Bioc 2.8（R-2.13）（9。5年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 2.10.0），生存，，，，矩阵， 方法
进口	图形，grdevices，统计，utils，生物基因，，，，Zlibbioc
链接
建议	Hexbin
系统要求
增强
URL
取决于我	eqtl，，，，GGBASE，，，，ggdata
进口我	funcisnp，，，，Genegeneinter，，，，ggtools，，，，gqtlstats，，，，ldblock，，，，马提尼，，，，RVS，，，，Scoreinvhap
建议我	crlmm，，，，Genomicfiles，，，，Gwascat，，，，Gwastools，，，，Omicrexposom，，，，OMICSPRINT，，，，变体
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	snpstats_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	snpstats_1.38.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	SNPSTATS_1.38.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snpstats
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/snpstats
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/snpstats/
软件包下载报告	下载统计