此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅structToolbox。
生物导体版本:3.11
一组广泛的数据(预)处理和分析方法和代谢组学和其他OMICS的工具,并非常重视统计和机器学习。该工具箱允许用户构建广泛而标准化的工作流以进行数据分析。方法和工具已经使用结构提供的基于类的模板(使用基于类的模板中的统计信息)软件包实现。该工具箱包括预处理方法(例如信号漂移和批化校正,归一化,缺失的价值插图和缩放),单变量(例如,ttest,各种形式的ANOVA,KRUSKAL – WALLIS测试等)以及多变量统计方法(例如,PCA和PLS和PLS和PLS和PLS和PLS,包括交叉验证和置换测试)以及机器学习方法(例如支持向量机)。统计本体(Stato)已集成并实施,以为不同方法,输入和输出提供标准化的定义。
作者:Gavin Rhys Lloyd [Aut,Cre],Ralf Johannes Maria Weber [AUT]
维护者:Gavin Rhys Lloyd
引用(从r内,输入引用(“ structToolbox”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ structToolbox”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
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browsevignettes(“ structToolbox”)
html | R脚本 | 使用structToolbox的代谢组学和其他OMIC数据集的数据分析 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 代谢组学,,,,软件,,,,工作流程 |
版本 | 1.0.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(0.5岁) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 4.0),结构(> = 0.99.10) |
进口 | GGPLOT2,,,,ggthemes, 网格,栅格, 方法,秤,,,,sp,统计 |
链接 | |
建议 | 农业,,,,Biocfilecache,,,,生物使用,,,,车,,,,COVR,,,,牛仔图,,,,E1071,,,,Emmeans,,,,ggdendro,,,,尼特,,,,魔术,,,,nlme,,,,OpenXLSX,,,,请,,,,PMP,,,,RESHAPE2,,,,ropls,,,,rmarkDown,,,,RTSNE,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | structToolbox_1.0.1.tar.gz |
Windows二进制 | structToolbox_1.0.1.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | structToolbox_1.0.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/StructToolbox |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/structtoolbox |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/Structtoolbox/ |
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