此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅hpannot。
生物导体版本:3.11
包含Hipathia软件包的示例和注释数据的软件包。Hipathia是一种从转录组数据中计算信号转导通路的信号转导方法的方法。该方法基于一种迭代算法,该算法能够考虑每个基因的表达水平以及信号到达该基因的强度来计算通过网络节点的信号强度。它还提供了一种新方法来进行功能分析,从而可以计算到到达每个途径的功能的信号到达的信号。Hipathia取决于此软件包的功能。
作者:Marta R. Hidalgo [AUT,CRE],JoséCarbonell-Caballero [CTB],Francisco Salavert [CTB],Alicia Amadoz [CTB],ÇankutCubuk[CTB],Joaquin Dopazo [CTB] [CTB]
维护者:Marta R. Hidalgo
引用(从r内,输入引用(“ hpannot”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ hpannot”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ hpannot”)
R脚本 | hpannot | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,CustomDbschema,,,,函数通道,,,,包装类型 |
版本 | 1.0.1 |
执照 | GPL-2 |
要看 | R(> = 3.5) |
进口 | |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | hpannot_1.0.1.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/hpannot/ |
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