此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MMAPPR2data.
Bioconductor版本:3.11
在MMAPPR2包中包含用于演示的数据,即模拟BAM文件,其中包含从GRCz11基因组中提取的slc24a5基因突变的RNA-Seq数据。还包含区域的引用序列和注释文件。
作者:Kyle Johnsen [aut], Jonathon Hill [cre]
维护者:Jonathon Hill
引文(从R内,输入引用(“MMAPPR2data”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MMAPPR2data")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MMAPPR2data”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用MMAPPR2data资源 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | Danio_rerio_Data,ExperimentData,基因组,RNASeqData,SequencingData |
版本 | 1.2.0 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.6.0) |
进口 | Rsamtools |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,roxygen2,seqinr,readr |
SystemRequirements | |
增强了 | MMAPPR2 |
URL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3613585/https://github.com/kjohnsen/MMAPPR2 |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | MMAPPR2 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MMAPPR2data_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MMAPPR2data |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MMAPPR2data |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MMAPPR2data/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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