MMAPPR2data

DOI:10.18129 / B9.bioc.MMAPPR2data

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MMAPPR2data

MMAPPR2的示例数据

Bioconductor版本:3.11

在MMAPPR2包中包含用于演示的数据,即模拟BAM文件,其中包含从GRCz11基因组中提取的slc24a5基因突变的RNA-Seq数据。还包含区域的引用序列和注释文件。

作者:Kyle Johnsen [aut], Jonathon Hill [cre]

维护者:Jonathon Hill

引文(从R内,输入引用(“MMAPPR2data”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MMAPPR2data")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MMAPPR2data”)

超文本标记语言 R脚本 使用MMAPPR2data资源
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews Danio_rerio_DataExperimentData基因组RNASeqDataSequencingData
版本 1.2.0
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.6.0)
进口 Rsamtools
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyleroxygen2seqinrreadr
SystemRequirements
增强了 MMAPPR2
URL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3613585/https://github.com/kjohnsen/MMAPPR2
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 MMAPPR2data_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MMAPPR2data
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MMAPPR2data
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/MMAPPR2data/
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