RforProteomics

DOI:10.18129 / B9.bioc.RforProteomics

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见RforProteomics．

“使用R和Bioconductor进行蛋白质组学数据分析”出版物的配套包

Bioconductor版本:3.11

此包包含演示“使用R和Bioconductor进行蛋白质组学数据分析”和“使用R和Bioconductor可视化蛋白质组学数据”手稿的代码。小插图描述了复制论文中描述的例子和图所需的代码和数据，以及蛋白质组学可视化的功能。它还包含各种功能，发现R软件质谱和蛋白质组学。

作者:Laurent Gatto [aut, cre]， Sebastian Gibb [ctb]， Vlad Petyuk [ctb]， Thomas Pedersen Lin [ctb]

维护者:Laurent Gatto < Laurent。uclouvain的Gatto。be>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“RforProteomics”)

超文本标记语言	R脚本	用R进行蛋白质组学数据分析
超文本标记语言	R脚本	利用R和Bioconductor可视化蛋白质组学数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData，MassSpectrometryData，ReproducibleResearch
版本	1.26.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5)，MSnbase(> = 2.5.3)
进口	R.utils，闪亮的，biocViews，BiocManager
链接
建议	AnnotationDbi，rpx，DT，knitr，rmarkdown，BiocStyle，mzR，xcms，msdata，等压线，MALDIquant(> = 1.12),MALDIquantForeign，readBrukerFlexData，synapter，synapterdata，IPPD，Rdisop，OrgMassSpecR，SummarizedExperiment，大脑，的方式，hpar，GO.db，org.Hs.eg.db，e1071，biomaRt，RColorBrewer，ggplot2，reshape2，xtable，晶格，mzID，pRoloc，pRolocdata，MSnID，msmsTests，msmsEDA，部，corrplot，beanplot，Heatplus，gplots，维恩图，protViz，genefilter，情节，gridExtra，dplyr，lubridate，魔法，切肉刀
SystemRequirements
增强了
URL	http://lgatto.github.com/RforProteomics/
全靠我
进口我
建议我	MSstatsQC，proteoQC，qcmetrics
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	RforProteomics_1.26.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/RforProteomics
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RforProteomics
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RforProteomics/
软件包下载报告	下载数据