这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ccTutorial。
Bioconductor版本:3.11
这个数据包伴随ChIP-chip教程,已经发表在PLoS计算生物学。这个包中的数据和源代码允许读者完全复制本教程中的步骤。
作者:Joern Toedling,沃尔夫冈•休伯
维护人员:Joern Toedling < Joern。在curie.fr toedling >
从内部引用(R,回车引用(“ccTutorial”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ccTutorial”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ccTutorial”)
R脚本 | 关于如何分析的教程使用Bioconductor ChIP-chip读数 | |
R脚本 | 补充一个教程如何分析使用Bioconductor ChIP-chip读数 | |
参考手册 |
biocViews | ChipOnChipData,ExperimentData,MicroarrayData,Mus_musculus_Data |
版本 | 1.26.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 2.10),林格(> = 1.9.8),affy(> = 1.23.4),topGO(> = 1.13.1) |
进口 | Biobase |
链接 | |
建议 | biomaRt,Biobase(> = 2.5.5),xtable |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | ccTutorial_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13(高山脉) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ccTutorial |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ccTutorial |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/ccTutorial/ |
包下载报告 | 下载数据 |