pasillaBamSubset

DOI:10.18129 / B9.bioc.pasillaBamSubset

该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见pasillaBamSubset

来自“Pasilla”实验的BAM文件子集

Bioconductor版本:3.11

未经处理的BAM文件的子集1。Bam(单端读取)和未经处理的3。bam(成对末端读取)来自“Pasilla”实验(由Brooks et al., Genome Research 2011)。请参阅pasilla数据包中的小插图,了解BAM文件是如何未经处理的。砰,未经治疗。bam从NCBI Gene Expression Omnibus提供的RNA-Seq读序列数据中获得,登录号为GSM461176至GSM461181。也包含了果蝇4号染色体的DNA序列,这些DNA序列可以被定位。

作者:hervevev pag

维护者:hervevev pag

引用(来自R,输入引用(“pasillaBamSubset”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager",悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" pasillabam子集")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews DNASeqDataExperimentData基因组RNASeqData
版本 0.26.0
许可证 LGPL
取决于
进口
链接
建议 pasilla
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我 GenomicAlignmentsGenomicFeaturesGenomicRangesgmovizIRangeskaryoploteRplyrangesTransView
链接到我
构建报告

包档案

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源包 pasillaBamSubset_0.26.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/pasillaBamSubset
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ pasillabam子集
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/pasillaBamSubset/
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