该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见pasillaBamSubset。
Bioconductor版本:3.11
未经处理的BAM文件的子集1。Bam(单端读取)和未经处理的3。bam(成对末端读取)来自“Pasilla”实验(由Brooks et al., Genome Research 2011)。请参阅pasilla数据包中的小插图,了解BAM文件是如何未经处理的。砰,未经治疗。bam从NCBI Gene Expression Omnibus提供的RNA-Seq读序列数据中获得,登录号为GSM461176至GSM461181。也包含了果蝇4号染色体的DNA序列,这些DNA序列可以被定位。
作者:hervevev pag
维护者:hervevev pag
引用(来自R,输入引用(“pasillaBamSubset”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager",悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" pasillabam子集")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放。
参考手册 |
biocViews | DNASeqData,ExperimentData,基因组,RNASeqData |
版本 | 0.26.0 |
许可证 | LGPL |
取决于 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | pasilla |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | GenomicAlignments,GenomicFeatures,GenomicRanges,gmoviz,IRanges,karyoploteR,plyranges,TransView |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | pasillaBamSubset_0.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/pasillaBamSubset |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ pasillabam子集 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/pasillaBamSubset/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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