此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见RNAseq123.
Bioconductor版本:3.11
R包,支持f1000研究工作流程文章的RNA-seq分析使用limma, Glimma和edgeR由Law等人(2016)。
作者:慈善法,阿罕杜什修女,苏诗安,董学义,田鲁一,戈登·史密斯和马修·里奇
维护者:Matthew Ritchie
引用(从R中,输入引用(“RNAseq123”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“RNAseq123”)
超文本标记语言 | R脚本 | rna seq分析简单如1-2-3 limma, Glimma和edgeR(中文版本) |
超文本标记语言 | R脚本 | rna seq分析简单如1-2-3 limma, Glimma和edgeR(英文版) |
biocViews | GeneExpressionWorkflow,ImmunoOncologyWorkflow,工作流 |
版本 | 1.12.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.3.0),Glimma(> = 1.1.9),limma,刨边机,gplots,RColorBrewer,Mus.musculus,R.utils |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://f1000research.com/articles/5-1408/v3 |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | RNAseq123_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAseq123 |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAseq123 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/RNAseq123/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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