eQTL

DOI:10.18129 / B9.bioc.eQTL

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅eQTL。

应用云计算的cis-eQTL搜索与Bioconductor GGtools 5. x

Bioconductor版本:3.11

此工作流关注搜索eQTL cis,所以本地的DNA变异基因表达的化验检测协会。

作者:文森特·凯里(aut (cre)

维修工:文森特·凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“eQTL”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“eQTL”)

HTML

R脚本

应用云计算的cis-eQTL搜索与Bioconductor GGtools 5. x

细节

biocViews	GenomicVariantsWorkflow,工作流
版本	1.12.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3.0),GGdata,GGtools,GenomeInfoDb,S4Vectors,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37,助理,biglm,data.table,doParallel,foreachknitcitations,光民,lumiHumanAll.db平行,rmeta,scatterplot3d,snpStats、网格yri1kgv
进口
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/help/workflows/eQTL/
取决于我
进口我
建议我
我的链接

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	eQTL_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eQTL
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ eQTL
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/eQTL/
包下载报告	下载数据