王牌

DOI:10.18129 / B9.bioc.ACE

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见王牌．

基于低覆盖率全基因组测序的绝对拷贝数估计

Bioconductor版本:3.12

利用分段拷贝数数据估计肿瘤细胞百分比，并产生显示绝对拷贝数的拷贝数图。

作者:Jos B Poell

维护者:Jos B Poell

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“王牌”)

超文本标记语言	R脚本	ACE装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，报道，DNASeq，测序，软件，可视化，WholeGenome
版本	1.8.0
在Bioconductor公司	BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.4)
进口	Biobase，QDNAseq，ggplot2，网格，统计，utils，方法，grDevices，GenomicRanges
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/tgac-vumc/ACE
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ACE_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	ACE_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ACE_1.8.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/ACE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ACE
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ACE/
软件包下载报告	下载数据