该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅等位基因平衡。
生物导体版本:3.12
使用RNA-seq数据为等位基因表达研究提供了一个框架。
作者:Jesper R Gadin,Lasse Folkersen
维护者:jesper r gadin
引用(从r内,输入引用(“等位基因平衡”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ allelicimpalance”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“等位基因平衡”)
R脚本 | 等位基因平衡小插图 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 遗传学,,,,基础设施,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.28.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(7。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 4.0.0),网格,基因组机(> = 1.31.8),总结性特征(> = 0.2.0),基因组签名(> = 1.15.6) |
进口 | 方法,生物基因,,,,AnnotationDbi,,,,BSGENOME(> = 1.47.3),变体(> = 1.25.11),生物弦(> = 2.47.6),S4VECTORS(> = 0.17.25),iranges(> = 2.13.12),rsamtools(> = 1.99.3),GenomicFeatures(> = 1.31.3),GVIZ,,,,格子,,,,LatticeExtra,,,,栅格,,,,seqinr,,,,GenomeInfodB,,,,nlme |
链接 | |
建议 | 测试,,,,org.hs.eg.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/pappewaio/allelicimbalance |
BugReports | https://github.com/pappewaio/allelicimbalance/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Allelicimbalance_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | AlleLicimbalance_1.28.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Allelicimbalance_1.28.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/allowricimbalance |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/等位基因影响 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/allowricimbalance/ |
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