此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见AnnotationHub.
Bioconductor版本:3.12
这个包为Bioconductor AnnotationHub web资源提供了一个客户机。AnnotationHub web资源提供了一个中心位置,可以在这里发现基因组文件(如VCF、bed、wig)和来自标准位置的其他资源(如UCSC、ensemble bl)。资源包括关于每个资源的元数据,例如文本描述、标签和修改日期。客户端创建和管理用户检索到的文件的本地缓存,帮助实现快速和可复制的访问。
作者:Bioconductor Package Maintainer [cre], Martin Morgan [aut], Marc Carlson [ctb], Dan Tenenbaum [ctb], Sonali Arora [ctb], Valerie Oberchain [ctb], Kayla Morrell [ctb], Lori Shepherd [aut]
维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者
引用(从R中,输入引用(“AnnotationHub”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("AnnotationHub")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“AnnotationHub”)
超文本标记语言 | R脚本 | AnnotationHub:访问AnnotationHub Web服务 |
超文本标记语言 | R脚本 | AnnotationHub: AnnotationHub HOW TO's |
超文本标记语言 | AnnotationHub:创建AnnotationHub包 | |
超文本标记语言 | R脚本 | 故障诊断的中心 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | AnnotationHub_2.22.1.tar.gz |
Windows二进制 | AnnotationHub_2.22.1.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | AnnotationHub_2.22.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnnotationHub |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AnnotationHub |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/AnnotationHub/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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