ArrayTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.ArrayTools

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见ArrayTools．

geneChip分析包

Bioconductor版本:3.12

该软件包旨在为Affymetrix基因芯片提供质量评估和检测差异表达基因的解决方案，包括3' -阵列和基因1.0-ST阵列。该软件包以HTML格式生成全面的分析报告。报告页面上的超链接将引导到一系列QC图、处理数据和差异表达基因列表。差异表达基因报告在表格格式与注释超链接到在线生物数据库。

作者:吴锡伟，Arthur Li

维护人员:Arthur Li

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ArrayTools")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“ArrayTools”)

PDF	R脚本	1.底漆
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释，DifferentialExpression，微阵列，OneChannel，预处理，质量控制，ReportWriting，软件，StatisticalMethod，可视化
版本	1.50.0
Bioconductor自	BioC 2.3 (R-2.8)(12.5年)
许可证	LGPL (> = 2.0)
取决于	R (> = 2.7.0),affy(> = 1.23.4),Biobase(> = 2.5.5)方法
进口	affy，Biobase、图形、grDeviceslimma，方法，统计，效用，xtable
链接
建议	simpleaffy，R2HTML，affydata，affyPLM，genefilter，annaffy，gcrma，hugene10sttranscriptcluster.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ArrayTools_1.50.0.tar.gz
Windows二进制	ArrayTools_1.50.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ArrayTools_1.50.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ArrayTools
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ArrayTools
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ArrayTools/
包下载报告	下载数据