生物脑

doi：10.18129/b9.bioc.biocneighbors

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅生物脑。

最近的邻居检测到生物通用包装

生物导体版本：3.12

在一个框架中，可以轻松地在生物处理器软件包或工作流程中切换它们的框架，以实现准确的近似方法。可以使用K-Means对K-Nearest邻居算法或具有优势点树进行精确搜索。可以使用烦恼或HNSW库进行近似搜索。支持在欧几里得或曼哈顿距离上进行搜索。通过使用BioCparallel，可以实现所有方法的并行化。还提供了功能来搜索给定距离内的所有邻居。

作者：Aaron Lun [AUT，CRE，CPH]

维护者：aaron lun

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ Biocneighbors”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Biocneighbors”）

html	R脚本	1.检测确切的最近邻居
html	R脚本	2.检测大约最近的邻居
html	R脚本	3.检测范围内的邻居
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	分类，，，，聚类，，，，软件
版本	1.8.2
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（2。5年）
执照	GPL-3
要看
进口	RCPP，，，，S4VECTORS，，，，生物比较，统计，方法，矩阵
链接	RCPP，，，，rcpphnsw
建议	测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，fnn，，，，rcppannoy，，，，rcpphnsw
系统要求	C ++ 11
增强
URL
取决于我
进口我	Batchelor，，，，Bluster，，，，细胞混蛋，，，，Cydar，，，，细胞动力，，，，flowspy，，，，评分，，，，scdblfinder，，，，斯克兰，，，，辛格
建议我	TSCAN
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Biocneighbors_1.8.2.tar.gz
Windows二进制	biocneighbors_1.8.2.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	Biocneighbors_1.8.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocneighbors
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/biocneighbors
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/biocneighbors/
软件包下载报告	下载统计