CSSQ

DOI:10.18129 / B9.bioc.CSSQ

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CSSQ．

芯片序列信号量化器管道

Bioconductor版本:3.12

此包用于执行统计分析，以识别多组ChIP-seq数据集之间统计上显著的差异绑定区域。

作者:Ashwath Kumar [aut]， Yajun Mei [aut]， Yuhong Fan [aut]

维护人员:乔治亚理工学院风扇实验室<雨虹。粉丝:biy.gatech.edu >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“CSSQ”)

超文本标记语言	R脚本	CSSQ简介
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，DifferentialPeakCalling，归一化，测序，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor公司	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	SummarizedExperiment，GenomicRanges，IRanges，S4Vectors，rtracklayer
进口	GenomicAlignments，GenomicFeatures，Rsamtools，ggplot2， grDevices, stats, utils
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	CSSQ_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	CSSQ_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	CSSQ_1.2.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/CSSQ
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CSSQ
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CSSQ/
软件包下载报告	下载数据