类别

DOI:10.18129 / B9.bioc.Category

该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见类别

类别分析

Bioconductor版本:3.12

执行类别(基因集富集)分析的工具集合。

作者:Robert Gentleman [aut], Seth Falcon [cbr], Deepayan Sarkar [cbr], Robert Castelo [cbr], Bioconductor Package维护者[cbr]

维护者:Bioconductor Package维护者< maintainer@bioconductor.org >

引用(来自R,输入引用(“类别”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager",悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Category")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“类别”)

PDF R脚本 使用分类分析微阵列数据
PDF R脚本 以染色体带作为分类
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释GeneSetEnrichment通路软件
版本 2.56.0
在Bioconductor中 BioC 1.6 (R-2.1)或更早(bbb16年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法、stats4BiocGenericsAnnotationDbiBiobase矩阵
进口 跑龙套,统计数据,RBGLGSEABasegenefilter注释DBI
链接
建议 EBarrays所有RgraphvizRColorBrewerxtable(> = 1.4 6),hgu95av2.dbKEGG.dbkaryoploteRgeneplotterlimma晶格RUnitorg.Sc.sgd.dbGOstatsGO.db
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我 GOstatsPCpheno
进口我 狂欢节categoryComparecellHTS2eisaGmicRinteractiveDisplaymeshrmiRLABPCphenophenoTestppiStatsRDAVIDWebServiceReportingToolsscTensor
建议我 BiocCaseStudiesGSEAlmMmPalateMiRNAqpgraphRnBeads
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 Category_2.56.0.tar.gz
Windows二进制 Category_2.56.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) Category_2.56.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/Category
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/Category
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/Category/
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