ChromHeatMap

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChromHeatMap

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ChromHeatMap

基因组坐标绘制热图

Bioconductor版本:3.12

ChromHeatMap包可用于沿给定染色体的每条链绘制全基因组数据(例如,表达,CGH, SNP)作为热图。生成的热图可用于交互式地识别感兴趣的探针和基因。

作者:Tim F. Rayner

维护者:Tim F. Rayner

引文(从R内,输入引用(“ChromHeatMap”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ChromHeatMap")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ChromHeatMap”)

PDF R脚本 用ChromHeatMap绘制表达式数据
PDF 参考手册

细节

biocViews 软件可视化
版本 1.44.0
在Bioconductor BioC 2.5 (R-2.10)(11.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.9.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),注释(> = 1.20.0),AnnotationDbi(> = 1.4.0)
进口 Biobase(>= 2.17.8),图形,grDevices,方法,统计,IRangesrtracklayerGenomicRanges
链接
建议 所有hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 ChromHeatMap_1.44.0.tar.gz
Windows二进制 ChromHeatMap_1.44.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ChromHeatMap_1.44.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChromHeatMap
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ChromHeatMap
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ChromHeatMap/
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