CoRegFlux

DOI:10.18129 / B9.bioc.CoRegFlux

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见CoRegFlux

CoRegFlux

Bioconductor版本:3.12

CoRegFlux旨在提供工具,将逆向工程基因调控网络和基因表达整合到代谢模型中,通过转录因子或基因(TF)在各种条件下的敲除或过表达,提高代谢工程的表型预测,以及提高我们对相互作用和细胞内部工作的理解。

作者:Pauline Trébulle, Daniel Trejo-Banos, Mohamed Elati

维护者:Pauline Trébulle和Mohamed Elati

引文(从R内,输入引用(“CoRegFlux”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CoRegFlux")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“CoRegFlux”)

超文本标记语言 R脚本 CoRegFlux
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpressionGenePredictionGeneRegulation网络软件SystemsBiology转录
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.6)
进口 CoRegNet西比尔
链接
建议 glpkAPItestthatknitrrmarkdown消化R.cacheggplot2plyrigraph、方法、latex2exprBayesianOptimization
SystemRequirements GLPK (>= 4.42)
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 CoRegFlux_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 CoRegFlux_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) CoRegFlux_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CoRegFlux
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CoRegFlux
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/CoRegFlux/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: