此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见CoRegFlux.
Bioconductor版本:3.12
CoRegFlux旨在提供工具,将逆向工程基因调控网络和基因表达整合到代谢模型中,通过转录因子或基因(TF)在各种条件下的敲除或过表达,提高代谢工程的表型预测,以及提高我们对相互作用和细胞内部工作的理解。
作者:Pauline Trébulle, Daniel Trejo-Banos, Mohamed Elati
维护者:Pauline Trébulle和Mohamed Elati
引文(从R内,输入引用(“CoRegFlux”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CoRegFlux")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“CoRegFlux”)
超文本标记语言 | R脚本 | CoRegFlux |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,GenePrediction,GeneRegulation,网络,软件,SystemsBiology,转录 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(2年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.6) |
进口 | CoRegNet,西比尔 |
链接 | |
建议 | glpkAPI,testthat,knitr,rmarkdown,消化,R.cache,ggplot2,plyr,igraph、方法、latex2exp,rBayesianOptimization |
SystemRequirements | GLPK (>= 4.42) |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | CoRegFlux_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | CoRegFlux_1.6.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | CoRegFlux_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CoRegFlux |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CoRegFlux |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/CoRegFlux/ |
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