CopyNumberPlots

DOI:10.18129 / B9.bioc.CopyNumberPlots

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CopyNumberPlots．

使用核ploter功能创建复制数图

Bioconductor版本:3.12

copynumberplot具有一组扩展了核型图功能的函数，可以创建漂亮的、可定制的、灵活的复制数相关数据图。

作者:Bernat Gel 和Miriam Magallon

维护器:Bernat Gel

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“CopyNumberPlots”)

超文本标记语言	R脚本	CopyNumberPlots装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，报道，DNASeq，DataImport，OneChannel，测序，软件，可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor公司	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.6)，karyoploteR
进口	地区，IRanges，Rsamtools，SummarizedExperiment，VariantAnnotation，方法，统计，GenomeInfoDb，GenomicRanges，cn.mops，rhdf5,跑龙套
链接
建议	BiocStyle，knitr，panelcn.mops，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked，DNAcopy，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots
BugReports	https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots/issues
全靠我
进口我	CNVfilteR
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	CopyNumberPlots_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	CopyNumberPlots_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	CopyNumberPlots_1.6.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/CopyNumberPlots
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CopyNumberPlots
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CopyNumberPlots/
软件包下载报告	下载数据