damefinder

doi：10.18129/b9.bioc.damefinder

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅damefinder。

找到dames-差分等位基因甲基化区域

生物导体版本：3.12

“ damefinder”提供了用于服用甲基甲烷或bismark输出来计算ASM分数和计算坝的功能。它还提供了甲基圆形图的不错的可视化。

作者：Stephany Orjuela [AUT，CRE]，Dania Machlab [Aut]，Mark Robinson [aut]

维护者：stephany orjuela

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ damefinder”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ damefinder”）

html	R脚本	damefinder工作流程
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	覆盖范围，，，，DNAMETHYLATY，，，，差甲基化，，，，软件
版本	1.2.0
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（1年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 4.0）
进口	统计，GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，readr，，，，总结性特征，，，，基因组签名，，，，Stringr，，，，plyr，，，，变体， 平行，GGPLOT2，，，，rsamtools，，，，生物基因， 方法，林玛，，，，Bumphunter，，，，生物弦，，，，RESHAPE2，，，，牛仔图，UTILS
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，rtracklayer，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/markrobinsonuzh/damefinder/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	damefinder_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	damefinder_1.2.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	damefinder_1.2.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/damefinder
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/damefinder
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/damefinder/
软件包下载报告	下载统计