DAPAR

DOI:10.18129 / B9.bioc.DAPAR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见DAPAR

蛋白质丰度差异分析工具与R

Bioconductor版本:3.12

这个包包含了蛋白质组数据可视化和统计分析的功能集合。

作者:Samuel Wieczorek [cre,aut], Florence Combes [aut], Thomas Burger [aut], Cosmin Lazar [ctb], Alexia Dorffer [ctb], Anais Courtier [ctb], Helene Borges [ctb], Enora Fremy [ctb]

维护者:Samuel Wieczorek < Samuel。Wieczorek在cea.fr>

引文(从R内,输入引用(“DAPAR”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("DAPAR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“DAPAR”)

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文本 新闻

细节

biocViews DataImportMassSpectrometry归一化预处理蛋白质组学质量控制软件
版本 1.22.9
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(5.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.0.3)
进口 BiobaseMSnbase宠物猫RColorBrewer统计数据,preprocessCore开罗png晶格reshape2gplotspcaMethodsggplot2limmaknitrtmvtnorm规范嫁祸于stringr, grDevices,图形,openxlsx跑龙套,cp4p(> = 0.3.5),尺度矩阵vioplotimp4p(> = 0.8),forcats、方法、highcharterDAPARdata(> = 1.18.0),siggeneslme4readxlclusterProfilerdplyrtidyrAnnotationDbitidyversevsnFactoMineRfactoextramultcomppurrrvisNetworkforeach平行,doParalleligraphdendextendMfuzzapclusterdiptest集群
链接
建议 BiocGenericstestthatBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL http://www.prostar-proteomics.org/
BugReports https://github.com/samWieczorek/DAPAR/issues
全靠我
进口我 Prostar
建议我 DAPARdata
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 DAPAR_1.22.9.tar.gz
Windows二进制 DAPAR_1.22.9.zip
macOS 10.13 (High Sierra) DAPAR_1.22.9.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DAPAR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DAPAR
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/DAPAR/
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