此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见DAPAR.
Bioconductor版本:3.12
这个包包含了蛋白质组数据可视化和统计分析的功能集合。
作者:Samuel Wieczorek [cre,aut], Florence Combes [aut], Thomas Burger [aut], Cosmin Lazar [ctb], Alexia Dorffer [ctb], Anais Courtier [ctb], Helene Borges [ctb], Enora Fremy [ctb]
维护者:Samuel Wieczorek < Samuel。Wieczorek在cea.fr>
引文(从R内,输入引用(“DAPAR”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("DAPAR")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“DAPAR”)
R脚本 | Prostar用户手册 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,去,MassSpectrometry,归一化,预处理,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 | 1.22.9 |
在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(5.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.0.3) |
进口 | Biobase,MSnbase,宠物猫,RColorBrewer统计数据,preprocessCore,开罗,png,晶格,reshape2,gplots,pcaMethods,ggplot2,limma,knitr,tmvtnorm,规范,嫁祸于,stringr, grDevices,图形,openxlsx跑龙套,cp4p(> = 0.3.5),尺度,矩阵,vioplot,imp4p(> = 0.8),forcats、方法、highcharter,DAPARdata(> = 1.18.0),siggenes,图,lme4,readxl,clusterProfiler,dplyr,tidyr,AnnotationDbi,tidyverse,vsn,FactoMineR,factoextra,multcomp,purrr,visNetwork,foreach平行,doParallel,igraph,dendextend,Mfuzz,apcluster,diptest,集群 |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,testthat,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.prostar-proteomics.org/ |
BugReports | https://github.com/samWieczorek/DAPAR/issues |
全靠我 | |
进口我 | Prostar |
建议我 | DAPARdata |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | DAPAR_1.22.9.tar.gz |
Windows二进制 | DAPAR_1.22.9.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | DAPAR_1.22.9.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DAPAR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DAPAR |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DAPAR/ |
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