DEScan2

DOI:10.18129 / B9.bioc.DEScan2

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见DEScan2．

差异富集扫描2

Bioconductor版本:3.12

集成峰值和差分调用器，专门为广泛的表观基因组信号设计。

作者:达里奥·里加里[aut, cre]，约翰·科贝尔斯坦[aut]，布鲁斯·戈麦斯[aut]，南希·张[aut]，克劳迪娅·安吉利尼[aut]，露西亚·佩克索[aut]，达维德·里索[aut]

维护者:Dario Righelli < Dario。在gmail.com>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“DEScan2”)

超文本标记语言	R脚本	DEScan2装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，表观遗传学，ImmunoOncology，PeakDetection，测序，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor公司	BioC 3.7 (R-3.5)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5)，GenomicRanges
进口	BiocParallel，BiocGenerics，ChIPpeakAnno，data.table，DelayedArray，GenomeInfoDb，GenomicAlignments，胶水，IRanges，plyr，Rcpp(> = 0.12.13),rtracklayer，S4Vectors(> = 0.23.19),SummarizedExperiment、工具、工具
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，刨边机，limma，EDASeq，RUVSeq，RColorBrewer，statmod
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	DEScan2_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	DEScan2_1.10.0.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	DEScan2_1.10.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/DEScan2
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DEScan2
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DEScan2/
软件包下载报告	下载数据