DEQMS

doi：10.18129/b9.bioc.deqms

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅DEQMS。

对定量蛋白质组学数据进行差异蛋白表达进行统计分析的工具。

生物导体版本：3.12

DEQM在Limma的顶部开发。但是，Limma假定所有基因的先验方差。在蛋白质组学中，蛋白质丰度估计的准确性随无标签和标记数据中量化的肽/PSM的数量而变化。通过多种肽或PSM的蛋白质定量更准确。DEQMS软件包能够估计通过不同数量的PSMS/肽量化的蛋白质的不同先前方差，因此可以提高准确性。该软件包可用于分析无标签和标记的蛋白质组学数据。

作者：Yafeng Zhu

维护者：yafeng zhu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ deqms”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ DEQMS”）

html	R脚本	DEQMS R MARKDOWN VIGNETTES
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	贝叶斯，，，，差异性，，，，免疫学，，，，质谱，，，，多重组合，，，，正常化，，，，预处理，，，，蛋白质组学，，，，软件
版本	1.8.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（2。5年）
执照	LGPL
要看	R（> = 3.5），图形，统计，GGPLOT2，，，，林玛（> = 3.34）
进口
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，plyr，，，，矩阵，，，，RESHAPE2，，，，农场，utils，Ggrepel，，，，实验室，，，，LSD
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/yafeng/deqms/issues
取决于我
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建议我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	deqms_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	deqms_1.8.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	deqms_1.8.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/deqms
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/deqms
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/deqms/
软件包下载报告	下载统计