剂量

doi：10.18129/b9.bioc.dos

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅剂量。

疾病本体论语义和富集分析

生物导体版本：3.12

该软件包分别实现了Resnik，Schlicker，Jiang，Lin和Wang提出的五种方法，用于测量DO术语和基因产品之间的语义相似性。还实施了包括高几何模型和基因集富集分析在内的富集分析，以发现高通量生物学数据的疾病关联。

作者：广琴Yu [aut，cre]，li-gen Wang [CTB]，Vladislav Petyuk [CTB]，Giovanni Dall'olio [CTB]，Erqiang Hu [CTB]

维护者：gmail.com> guangchuang yu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ dose”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“剂量”）

html	R脚本	剂量
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，基因烯，，，，多重组合，，，，途径，，，，软件，，，，可视化
版本	3.16.0
在生物导体中	Bioc 2.9（R-2.14）（9。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.5.0）
进口	AnnotationDbi，，，，生物比较，，，，do.db，，，，fgsea，，，，GGPLOT2，，，，Gosemsim（> = 2.0.0），方法，QVALUE，，，，RESHAPE2，统计，utils
链接
建议	Prettydoc，，，，clusterProfiler，，，，尼特，，，，org.hs.eg.db，，，，测试
系统要求
增强
URL	https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/
BugReports	https://github.com/guangchuangyu/dose/issues
取决于我
进口我	生物加工者，，，，clusterProfiler，，，，碎片器，，，，EEGC，，，，富集，，，，gdcrnatools，，，，林，，，，网眼，，，，mirsponger，，，，MOONLIGHTR，，，，途径图，，，，Reactomepa，，，，雷根里奇，，，，rnaseqr，，，，sctensor，，，，SignaturesEarch
建议我	可乐，，，，Gosemsim，，，，Mageckflute，，，，rrvgo，，，，SCGPS，，，，简化
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	dose_3.16.0.tar.gz
Windows二进制	dose_3.16.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	dose_3.16.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dose
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/剂量
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/dose/
软件包下载报告	下载统计