该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅延迟的matrixstats。
生物导体版本:3.12
从“ delayedArray”软件包中使用的“ matrixstats” API的端口可与delayedmatrix对象一起使用。高性能功能在行和延迟对象的列上运行,例如col / rowmedians(),col / rowranks()和col / rowsds()。每个数据类型和子集计算优化的函数,使内存使用和处理时间均可最大程度地减少。
作者:Peter Hickey [Aut,Cre],HervéPagès[CTB],Aaron Lun [CTB]
维护者:彼得·希基(Peter Hickey)
引用(从r内,输入引用(“ delaymatrixstats”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ delaysedmatrixstats”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ delaymatrixstats”)
html | R脚本 | 延迟matrixstats的概述 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | datarepresentation,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.12.3 |
在生物导体中 | Bioc 3.6(R-3.4)(3.5岁) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | 矩阵,,,,延迟(> = 0.15.3) |
进口 | 方法,矩阵(> = 0.56.0),Sparsematrixstats,,,,矩阵,,,,S4VECTORS(> = 0.17.5),iranges,,,,HDF5Array(> = 1.17.2),生物比较 |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,COVR,,,,生物使用,,,,微实验,,,,Profmem |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/petehaitch/delayedmatrixstats |
BugReports | https://github.com/petehaitch/delayedmatrixstats/issues |
取决于我 | |
进口我 | Batchelor,,,,饼干,,,,BSSEQ,,,,CellDex,,,,DMRSEQ,,,,弗雷泽,,,,Glmgampoi,,,,Methrix,,,,甲基化,,,,Minfi,,,,PCATOOLS,,,,评分,,,,Scmerge,,,,斯克兰,,,,砍伐,,,,Singlecelltk,,,,辛格,,,,Weitrix |
建议我 | 延迟,,,,矩阵,,,,mbkmeans,,,,SCPCA |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | delaymatrixstats_1.12.3.tar.gz |
Windows二进制 | delaymatrixstats_1.12.3.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | delaymatrixstats_1.12.3.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/delayedmatrixstats |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/delaymatrixstats |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/delayedmatrixstats/ |
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