埃达

DOI:10.18129 / B9.bioc.EDDA

该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见埃达。

差异丰度分析的实验设计

Bioconductor版本:3.12

EDDA可以帮助设计一系列常见的实验，如RNA-seq、纳米链分析、RIP-seq和宏基因组测序，并使研究人员能够全面研究实验决策对检测差异丰度能力的影响。这项工作发表在2014年12月3日的Genome Biology上，标题为“研究设计对于检测高通量实验中差异丰富特征的重要性”(http://genomebiology.com/2014/15/12/527)。

作者:李军涛，罗怀恩，贾广辉，伯顿，Niranjan Nagarajan

维护人员:Chia Kuan Hui Burton ， Niranjan Nagarajan < nagarajn at gis.a-star.edu.sg>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("EDDA")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“埃达”)

PDF		《埃达》插曲
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，ExperimentalDesign，ImmunoOncology，归一化，RNASeq，测序，软件
版本	1.28.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(7年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	Rcpp(>= 0.10.4)， parallel, methods，ROCR，DESeq，baySeq，雪，刨边机
进口	图形、统计、utils、并行、方法、ROCR，DESeq，baySeq，雪，刨边机
链接	Rcpp
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://edda.gis.a-star.edu.sg/http://genomebiology.com/2014/15/12/527
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	EDDA_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	EDDA_1.28.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	EDDA_1.28.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/EDDA
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/EDDA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/EDDA/
软件包下载报告	下载数据