肘

DOI:10.18129 / B9.bioc.ELBOW

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见肘．

用lOgit方法评估foLd变化

Bioconductor版本:3.12

肘是一种改进的折叠变化检验，它使用聚类分析和模式识别来设置截断限，直接从复制内方差得出，而不假设只有2个生物重复的正态分布。在跨平台分析中，弯头也提供了与折叠测试相同的一致性。当使用T检验和使用12个重复(初始和最终条件各6个重复)的微阵列统计分析对两者进行评估时，肘关节假阳性和假阴性率低于标准折叠试验。肘提供了一个基于初始条件复制的空值，并为结果提供了误差边界，以便更好地评估显著性。

作者:Xiangli Zhang, Natalie Bjorklund, Graham Alvare, Tom Ryzdak, Richard Sparling, Brian Fristensky

维护者:Graham Alvare < Alvare at cc.umanitoba。ca>，张祥丽

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("肘")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“肘部”)

PDF	R脚本	使用肘部——权威的肘部教程
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	GeneExpression，ImmunoOncology，微阵列，多通道，OneChannel，RNASeq，测序，软件，技术，TwoChannel
版本	1.26.0
在Bioconductor公司	BioC 2.14 (R-3.1)(7年)
许可证	文件许可证
取决于	R (>= 2.15.0)
进口	图形，统计，工具
链接
建议	DESeq，GEOquery，limma，simpleaffy，affyPLM，RColorBrewer，hgu133plus2cdf，hgu133plus2probe
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ELBOW_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	ELBOW_1.26.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ELBOW_1.26.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/ELBOW
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/肘
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ELBOW/
软件包下载报告	下载数据