该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅EncodeXplorer。
生物导体版本:3.12
此软件包允许用户快速访问编码项目文件元数据,并访问助手功能以查询编码REST API,下载编码数据集并以SQLITE格式保存数据库。
作者:Charles Joly Beauparlant [AUT,CRE],Audrey Lemacon [AUT],Eric Fournier [AUT],Louis Gendron [CTB],Astrid-Louise Deschenes [CTB],Arnaud Droit [aut]
维护者:Charles Joly Beauparlant
引用(从r内,输入引用(“ encodexplorer”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ encodexplorer”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ encodexplorer”)
html | R脚本 | EncodeXplorer |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 2.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(6年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.6) |
进口 | 方法,工具,jsonlite,,,,rcurl,,,,花花公子,,,,Data.Table,,,,dplyr,,,,Stringr,,,,Stringi,utils,AnnotationHub,,,,基因组机,,,,rtracklayer,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,EncodexplorerData |
链接 | |
建议 | 运行,,,,生物基因,,,,尼特,,,,卷曲,,,,httr,,,,闪亮的,,,,有光泽的人,,,,DT |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/charlesjb/encodexplorer/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | tsrchitect |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | encodexplorer_2.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | encodexplorer_2.16.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | encodexplorer_2.16.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/encodexplorer |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/encodexplorer |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/encodexplorer/ |
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