EncodeXplorer

doi:10.18129/b9.bioc.encodexplorer

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅EncodeXplorer

编码元数据的汇编

生物导体版本:3.12

此软件包允许用户快速访问编码项目文件元数据,并访问助手功能以查询编码REST API,下载编码数据集并以SQLITE格式保存数据库。

作者:Charles Joly Beauparlant [AUT,CRE],Audrey Lemacon [AUT],Eric Fournier [AUT],Louis Gendron [CTB],Astrid-Louise Deschenes [CTB],Arnaud Droit [aut]

维护者:Charles Joly Beauparlant

引用(从r内,输入引用(“ encodexplorer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ encodexplorer”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ encodexplorer”)

html R脚本 EncodeXplorer
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,基础设施,,,,软件
版本 2.16.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(6年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.6)
进口 方法,工具,jsonlite,,,,rcurl,,,,花花公子,,,,Data.Table,,,,dplyr,,,,Stringr,,,,Stringi,utils,AnnotationHub,,,,基因组机,,,,rtracklayer,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,EncodexplorerData
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,尼特,,,,卷曲,,,,httr,,,,闪亮的,,,,有光泽的人,,,,DT
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/charlesjb/encodexplorer/issues
取决于我
进口我
建议我 tsrchitect
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 encodexplorer_2.16.0.tar.gz
Windows二进制 encodexplorer_2.16.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) encodexplorer_2.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/encodexplorer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/encodexplorer
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/encodexplorer/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户