ExiMiR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExiMiR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ExiMiR

R函数用于Exiqon miRNA阵列数据的归一化

Bioconductor版本:3.12

这个包包含一些函数,用于从Exiqon miRCURY LNA数组中读取ImaGene TXT格式的原始数据,用适当的GAL文件注释它们,并使用基于探针的插入方法对它们进行规范化。还支持其他平台和数据格式。

作者:Sylvain Gubian ,Alain Sewer , PMP SA

维护者:Sylvain Gubian

引文(从R内,输入引用(“ExiMiR”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ExiMiR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ExiMiR”)

PDF R脚本 ExiMiR的描述
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews GeneExpression微阵列OneChannel预处理软件转录TwoChannel
版本 2.32.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(10年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.10),Biobase(> = 2.5.5),affy(> = 1.26.1),limma
进口 affyio(> = 1.13.3),Biobase(> = 2.5.5),preprocessCore(> = 1.10.0)
链接
建议 mirna10cdf
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 ExiMiR_2.32.0.tar.gz
Windows二进制 ExiMiR_2.32.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ExiMiR_2.32.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExiMiR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ExiMiR
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ExiMiR/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: