此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见FlowSOM.
Bioconductor版本:3.12
FlowSOM通过使用自组织映射聚类和最小生成树,为细胞术数据提供了可视化选项。
作者:苏菲·范·加森,布里特·卡利波特和伊万·赛斯
维护者:苏菲·范·加森<苏菲。Vangassen在ugent
引文(从R内,输入引用(“FlowSOM”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("FlowSOM")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“FlowSOM”)
R脚本 | FlowSOM | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBasedAssays,CellBiology,聚类,FlowCytometry,软件,可视化 |
版本 | 1.22.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(6年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.2),igraph |
进口 | 属性,跑龙套,flowCore,ConsensusClusterPlus,BiocGenerics,tsne,CytoML,flowWorkspace,XML,RColorBrewer |
链接 | |
建议 | BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.r-project.orghttp://dambi.ugent.be |
全靠我 | |
进口我 | 催化剂,cytofast,CytoTree,diffcyt,flowSpy,MetaCyto |
建议我 | HDCytoData |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | FlowSOM_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | FlowSOM_1.22.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | FlowSOM_1.22.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FlowSOM |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FlowSOM |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/FlowSOM/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: