此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GA4GHshiny.
Bioconductor版本:3.12
GA4GHshiny包通过Shiny应用程序提供了一种与基于全球基因组学与健康联盟(GA4GH)基因组学API的数据服务器交互的简单方法。它还与信标网络集成。
作者:Welliton Souza [aut, cre], Benilton Carvalho [ctb], Cristiane Rocha [ctb], Elizabeth Borgognoni [ctb]
维护者:Welliton Souza
引文(从R内,输入引用(“GA4GHshiny”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GA4GHshiny")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GA4GHshiny”)
超文本标记语言 | R脚本 | GA4GHshiny |
参考手册 |
biocViews | GUI,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | GA4GHclient |
进口 | AnnotationDbi,BiocGenerics,dplyr,DT,GenomeInfoDb,openxlsx,GenomicFeatures、方法、purrr,S4Vectors,闪亮的,shinyjs,tidyr,shinythemes |
链接 | |
建议 | BiocStyle,org.Hs.eg.db,knitr,rmarkdown,testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/labbcb/GA4GHshiny |
BugReports | https://github.com/labbcb/GA4GHshiny/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GA4GHshiny_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | GA4GHshiny_1.12.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | GA4GHshiny_1.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GA4GHshiny |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GA4GHshiny |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/GA4GHshiny/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: